• В закон «О борьбе с терроризмом» от 25 июля 1998 года вносится поправка: «Погребение террористов, умерших в результате пресечения террористической акции, осуществляется в порядке, устанавливаемом Правительством Российской Федерации. При этом их тела для захоронения не выдаются и о месте их захоронения не сообщается». («О внесении дополнения в Федеральный закон "О борьбе с терроризмом"», 21 ноября 2002 года)
• Старый закон «О борьбе с терроризмом» утрачивает силу, его сменяет новый закон «О противодействии терроризму» от 26 февраля 2006 года. Дано определение терроризму: «идеология насилия и практика воздействия на принятие решения органами государственной власти, органами местного самоуправления или международными организациями, связанные с устрашением населения и (или) иными формами противоправных насильственных действий».
«Террористический акт – совершение взрыва, поджога или иных действий, устрашающих население и создающих опасность гибели человека, причинения значительного имущественного ущерба либо наступления иных тяжких последствий, в целях воздействия на принятие решения органами власти или международными организациями, а также угроза совершения указанных действий в тех же целях".
Определены полномочия президента в деле противодействия терроризму.
Определён порядок использования вооружённых сил при терактах в самолётах и на судах.
Определены условия проведения контртеррористической операции:
1) силовые структуры вправе удалять людей и буксировать транспорт с места проведения операции;
2) прослушивать телефонные разговоры, перлюстрировать почту,
3) использовать транспорт, принадлежащий любым организациям и гражданам;
4) ограничивать граждан в использовании телефонной и других видов связи,
5) беспрепятственно проникать в жильё и прочее.
Утверждается размер компенсаций людям, участвовавшим в антитеррористических мероприятиях: родным погибших – шестьсот тысяч рублей, получившим увечья – триста тысяч рублей. Определены льготы и меры социальной поддержки таких лиц. («О противодействии терроризму» , 26 февраля 2006)
• Внесены поправки в закон «О противодействии легализации (отмыванию) доходов, полученных преступным путем, и финансированию терроризма»:
Банкам запрещено открывать счета физическим лицам без их физического присутствия. Кредитные организации, адвокаты и нотариусы должны сообщать в правоохранительных органах о сделках, вызывающих подозрение. Введены и другие меры по ужесточению контроля денежных операций.
Контроль осуществляется за финансовыми операциями не только «участвующих» в террористической деятельности, но и «причастных» к ней. («О внесении изменений в Федеральный закон ''О противодействии легализации (отмыванию) доходов, полученных преступным путем, и финансированию терроризма''» , 28 июля 2004 года)
• Внесены поправки в закон «О средствах массовой информации»:
СМИ запрещено распространять призывы к экстремистской деятельности, оправдывать терроризм. Во время контртеррористических операций журналистам запрещено раскрывать в публикациях детали их проведения. («О внесении изменений в отдельные законодательные акты Российской Федерации в связи с принятием Федерального закона «О ратификации конвенции совета Европы о предупреждении терроризма» и Федерального закона «О противодействии терроризму», 14 июля 2006, статья 2)
• Внесены поправки в закон «О федеральной службе безопасности»: во время контртеррористической операции спецслужбы могу проникать в жилище и ограничивать права граждан на тайну переписки и телефонных переговоров.
Решение о допустимости таких мер принимает судья по ходатайству руководителя ФСБ либо его заместителя, постановление судьи хранится в ФСБ. («О внесении изменений в отдельные законодательные акты Российской Федерации в связи с принятием Федерального закона «О ратификации конвенции совета Европы о предупреждении терроризма» и Федерального закона «О противодействии терроризму», 14 июля 2006, статья 3)
• Внесены поправки в Уголовный кодекс: человек, участвовавший в подготовке теракта, освобождается от ответственности, если вовремя предупредил власти о готовящемся преступлении. («О внесении изменений в отдельные законодательные акты Российской Федерации в связи с принятием Федерального закона «О ратификации конвенции совета Европы о предупреждении терроризма» и Федерального закона "О противодействии терроризму», 14 июля 2006, статья 4)
Введена уголовная ответственность за публичные призывы к осуществлению террористической деятельности, в том числе с использованием СМИ.
Признаётся возможным участие внутренних войск для борьбы с терроризмом. («О внесении изменений в отдельные законодательные акты Российской Федерации в связи с принятием Федерального закона «О ратификации конвенции совета Европы о предупреждении терроризма» и Федерального закона «О противодействии терроризму», 14 июля 2006, статья 5)
• Внесены поправки в Налоговый кодекс: вознаграждения за помощь в предотвращении и раскрытии терактов больше не облагаются налогами. («О внесении изменений в отдельные законодательные акты Российской Федерации в связи с принятием Федерального закона «О ратификации конвенции совета Европы о предупреждении терроризма» и Федерального закона «О противодействии терроризму», 14 июля 2006, статья 8)
• Внесены поправки в Уголовно-процессуальный кодекс: в случае, если обвиняемый в тяжких и особо тяжких преступлениях, находится за пределами России, судебное разбирательство может проводиться в его отсутствие, но с обязательным присутствием адвоката. («О внесении изменений в отдельные законодательные акты Российской Федерации в связи с принятием Федерального закона «О ратификации конвенции совета Европы о предупреждении терроризма» и Федерального закона «О противодействии терроризму», 14 июля 2006, статья 10).